Ιδιαίτερα, ο αρχηγός της Χρυσής Αυγής, Νίκος Μιχαλολιάκος συνδέεται με τη δολοφονία του Παύλου Φύσσα και άλλες σοβαρές επιθέσεις της οργάνωσης.
Ο Γιώργος Ρουπακιάς και δεκαπέντε ακόμη άτομα παραπέμπονται για τη δολοφονία Φύσσα, ενώ ο Ρουπακιάς κατηγορείται σύμφωνα με τα όσα περιλαμβάνονται στη δικογραφία, ότι είχε προετοιμάσει το έγκλημα καθώς έδρασε προς ένα άγνωστο προς αυτόν άτομο με τρόπο στοχευμένο καίριο και ταχύτατο.
Τα υπόλοιπα άτομα παραπέμπονται για τις μεγάλες και σοβαρές επιθέσεις της Χρυσής Αυγής, όπως κατά των αφισοκολλητών του ΚΚΕ και του ΠΑΜΕ στο Πέραμα, κατά των Αιγύπτιων ψαράδων, σε στέκι στην Ηλιούπολη κτλ.