Διενεργήθηκε στα γραφεία της Ελληνικής Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας η κλήρωση του αγωνιστικού προγράμματος για το Κύπελλο Ερασιτεχνών περιόδου 2012-2013. Η Κοζάνη την 1η αγωνιστική απέφυγε το ταξίδι σε Σέρρες και Χαλκιδική και θα παίξει στο Νεόκαστρο.
Πρέπει να τονιστεί ότι μετά τις εκπροσώπους από τις ΕΠΣ: Μακεδονίας (ΑΠΕ Λαγκαδά), Κιλκίς (Κιλκιασιακός), Πέλλας (Μέγας Αλέξανδρος Νέου Μυλότοπου), Φλώρινας (Απόλλων Αμμοχωρίου), Τρικάλων (Τρίκαλα), Θεσσαλίας (Πυρασος Νέας Αγχιάλου), Πρέβεζας/Λευκάδας (Εθνικός Φιλιππιάδας), Ευρυτανίας (Βελούχι), Δυτικής Αττικής (Μανδραϊκός), Εύβοιας (Χαλκίδα), Ζακύνθου (Θύελλα Αμπελοκήπων), Ηλείας (ΠΦΟ Πανόπουλου), Κορινθίας (ΠΑΟ Λουτρακίου), Πειραιά (Μοσχάτο), Λέσβου (Αιολικός), Κυκλάδων (Παναξιακός) και Ρεθύμνου (Ερμής Ζωνιανών), δεν δήλωσαν συμμετοχή και δεν κατεβαίνουν η κυπελλούχος της Ε.Π.Σ. Κέρκυρας και η Ακαδημία Πλαταμώνα από την Πιερία.
Το αναλυτικό πρόγραμμα ανά όμιλο:
1η Αγωνιστική (10/4-16:30)
1ος ΟΜΙΛΟΣ
Έβρος Σουφλίου-Παύλος Μελάς Κουτσού (1)
Άρης Ακροποτάμου-Δόξα Πετρούσας (2)
Προκρίνεται χωρίς αγώνα ΠΑΟΚ Κοσμίου
2ος ΟΜΙΛΟΣ
Απόλλων Παραλιμνίου Απόλλων Αρναίας (3)
Αχιλλέας Νεοκάστρου-Κοζάνη (4)
3ος ΟΜΙΛΟΣ
Πυρσός Γρεβενών Παναργειακός Ορεστικού (5)
Θεσπρωτός-ΑΟ Ανατολής (6)
4ος ΟΜΙΛΟΣ
Δόξα Αγίας Τριάδας- Δήμητρα Γιάννουλης (7)
Προκρίνεται χωρίς αγώνα ΠΑΣ Λαμία 1964
5ος ΟΜΙΛΟΣ
Αναγέννηση Άρτας-Αμβρακικός Λουτρού (8)
Επαμεινώνδας Λεύκτρων- Ανδρούτσος Γραβιάς (9)
6ος ΟΜΙΛΟΣ
Παναρκαδικός- ΑΕ Πελλάνας (10)
Παναργειακός ή –Τρροιζηνιακός-Κεραυνός Κερατέας (11)
7ος ΟΜΙΛΟΣ
Προκρίνεται χωρίς αγώνα Παγκεφαλληνιακός
Μεσσηνιακός –Ατρόμητος Λάππα (12)
8ος ΟΜΙΛΟΣ
Όμηρος Καλλιμασιάς –Ελπιδοφόρος (13)
ΠΑΣ Ίκαρος-Φοίβος Κρεμαστής (14)
2η ΑΓΩΝΙΣΤΙΚΗ (17/4-16:30
1ος ΟΜΙΛΟΣ
Έβρος Σουφλίου-Παύλος Μελάς Κουτσού (1)
Νικητής Άρης Ακροποτάμου-Δόξα Πετρούσας -ΠΑΟΚ Κοσμίου (15)
2ος ΟΜΙΛΟΣ
Νικητής Αχιλλέας Νεοκάστρου-Κοζάνη – Νικητής Απόλλων Παραλιμνίου Απόλλων Αρναίας (16)
3ος ΟΜΙΛΟΣ
Νικητής Πυρσός Γρεβενών-Παναργειακός Ορεστικού-Νικητής Θεσπρωτός-ΑΟ Ανατολής (17)
4ος ΟΜΙΛΟΣ
ΠΑΣ Λαμία 1964 –Νικητής Δόξα Αγίας Τριάδας- Δήμητρα Γιάννουλης (18)
5ος ΟΜΙΛΟΣ
Νικητής Επαμεινώνδας Λεύκτρων- Ανδρούτσος Γραβιάς- Νικητής Αναγέννηση Άρτας-Αμβρακικός Λουτρού (19)
6ος ΟΜΙΛΟΣ
Νικητής Παναρκαδικός- ΑΕ Πελλάνας – Νικητής (Παναργειακός ή Τρροιζηνιακός)-Κεραυνός Κερατέας (20)
7ος ΟΜΙΛΟΣ
Παγκεφαλληνιακός – Νικητής Μεσσηνιακός –Ατρόμητος Λάππα (21)
8ος ΟΜΙΛΟΣ
Νικητής ΠΑΣ Ίκαρος-Φοίβος Κρεμαστής- Νικητής Όμηρος Καλλιμασιάς –Ελπιδοφόρος (22)
9ος ΟΜΙΛΟΣ
Ιωνία Χανίων- Ηρόδοτος (23)
3η ΑΓΩΝΙΣΤΙΚΗ (24/4-16:30)
Νικητής αγώνα 15- Νικητής αγώνα 1 (24)
Αναγέννηση Ιεράπετρας- Νικητής αγώνα 23 (25)
4η Αγωνιστική (01/5/2013-16:30)
Νικητής αγώνα 22-Νικητής αγώνα 25
Προημιτελικά (22/5/13-16:30)
Νικητής αγώνα 21-Νικητής αγώνα 26 (27)
Νικητής αγώνα 19-Νικητής αγώνα 20 (28)
Νικητής αγώνα 16-Νικητής αγώνα 18 (29)
Νικητής αγώνα 17-Νικητής αγώνα 24 (30)
Ημιτελικοί (29/5/13-16:30)
Νικητής αγώνα 28-Νικητής αγώνα 29 (31)
Νικητής αγώνα 27- Νικητής αγώνα 30
Τελικός
Νικητές ημιτελικών
